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Biblioteca(s):  Embrapa Amazônia Ocidental.
Data corrente:  07/02/2024
Data da última atualização:  07/02/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ZUFFA, S.; SCHMID, R.; BAUERMEISTER, A.; GOMES, P. W. P.; CARABALLO-RODRIGUEZ, A. M.; EL ABIEAD, Y.; ARON, A. T.; GENTRY, E. C.; ZEMLIN, J.; MEEHAN, M. J.; AVALON, N. E.; CICHEWICZ, R. H.; BUZUN, E.; CARRILLO TERRAZAS, M.; HSU, C. Y.; OLES, R.; AYALA, A. V.; ZHAO, J.; CHU, H.; KUIJPERS, M. C. M.; JACKREL, S. L.; TUGIZIMANA, F.; NEPHALI, L. P.; DUBERY, I. A.; MADALA, N. E.; MOREIRA, E. A.; COSTA-LOTUFO, L. V.; LOPES, N. P.; REZENDE-TEIXEIRA, P.; JIMENEZ, P. C.; RIMAL, B.; PATTERSON, A. D.; TRAXLER, M. F.; PESSOTTI, R. de C.; ALVARADO-VILLALOBOS, D.; TAMAYO-CASTILLO, G.; CHAVERRI, P.; ESCUDERO-LEYVA, E.; QUIROS-GUERRERO, L. M.; BORY, A. J.; JOUBERT, J.; RUTZ, A.; WOLFENDER, J. L.; ALLARD, P. M.; SICHERT, A.; PONTRELLI, S.; PULLMAN, B. S.; BANDEIRA, N.; GERWICK, W. H.; GINDRO, K.; MASSANA-CODINA, J.; WAGNER, B. C.; FORCHHAMMER, K.; PETRAS, D.; AIOSA, N.; GARG, N.; LIEBEKE, M.; BOURCEAU, P.; KANG, K. B.; GADHAVI, H.; CARVALHO, L. P. S. de; SANTOS, M. S. dos; PÉREZ-LORENTE, A. I.; MOLINA-SANTIAGO, C.; ROMERO, D.; FRANKE, R.; BRÖNSTRUP, M.; PONCE DE LEÓN, A. V.; POPE, P. B.; LA ROSA, S. L.; LA BARBERA, G.; ROAGER, H. M.; LAURSEN, M. F.; HAMMERLE, F.; SIEWERT, B.; PEINTNER, U.; LICONA-CASSANI, C.; RODRIGUEZ-ORDUÑA, L.; RAMPLER, E.; HILDEBRAND, F.; KOELLENSPERGER, G.; SCHOENY, H.; HOHENWALLNER, K.; PANZENBOECK, L.; GREGOR, R.; O'NEILL, E. C.; ROXBOROUGH, E. T.; ODOI, J.; BALE, N. J.; DING, S.; DAMSTÉ, J. S. S.; GUAN, X. L.; CUI, J. J.; JU, K. S.; SILVA, D. B.; SILVA, F. M. R.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F.; GRUNDMANN, C.; CLEMENT, J. A.; MOHIMANI, H.; BRODERS, K.; McPHAIL, K. L.; OBER-SINGLETON, S. E.; RATH, C. M.; McDONALD, D.; KNIGHT, R.; WANG, M.; DORRESTEIN, P. C.
Afiliação:  SIMONE ZUFFA, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; ROBIN SCHMID, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; ANELIZE BAUERMEISTER, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; PAULO WENDER P. GOMES, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; ANDRES M. CARABALLO-RODRIGUEZ, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; YASIN EL ABIEAD, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; ALLEGRA T. ARON, UNIVERSITY OF DENVER; EMILY C. GENTRY, DEPARTMENT OF CHEMISTRY, VIRGINIA TECH; JASMINE ZEMLIN, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; MICHAEL J. MEEHAN, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; NICOLE E. AVALON, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; ROBERT H. CICHEWICZ, UNIVERSITY OF OKLAHOMA; EKATERINA BUZUN, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; MARVIC CARRILLO TERRAZAS, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; CHIA-YUN HSU, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; RENEE OLES, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; ADRIANA VASQUEZ AYALA, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; JIAQI ZHAO, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; HIUTUNG CHU, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; MIRTE C. M. KUIJPERS, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; SARA L. JACKREL, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; FIDELE TUGIZIMANA, UNIVERSITY OF JOHANNESBURG; LERATO PERTUNIA NEPHALI, UNIVERSITY OF JOHANNESBURG; IAN A. DUBERY, UNIVERSITY OF JOHANNESBURG; NTAKADZENI EDWIN MADALA, UNIVERSITY OF VENDA; EDUARDA ANTUNES MOREIRA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LETICIA VERAS COSTA-LOTUFO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; NORBERTO PEPORINE LOPES, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; PAULA REZENDE-TEIXEIRA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; PAULA C. JIMENEZ, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; BIPIN RIMAL, PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY; ANDREW D. PATTERSON, PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY; MATTHEW F. TRAXLER, UNIVERSITY OF CALIFORNIA BERKELEY; RITA DE CASSIA PESSOTTI, UNIVERSITY OF CALIFORNIA BERKELEY; DANIEL ALVARADO-VILLALOBOS, UNIVERSIDAD DE COSTA RICA; GISELLE TAMAYO-CASTILLO, UNIVERSIDAD DE COSTA RICA; PRISCILA CHAVERRI, UNIVERSIDAD DE COSTA RICA; EFRAIN ESCUDERO-LEYVA, UNIVERSIDAD DE COSTA RICA; LUIS-MANUEL QUIROS-GUERRERO, UNIVERSITY OF GENEVA; ALEXANDRE JEAN BORY, UNIVERSITY OF GENEVA; JULIETTE JOUBERT, UNIVERSITY OF GENEVA; ADRIANO RUTZ, UNIVERSITY OF GENEVA; JEAN-LUC WOLFENDER, UNIVERSITY OF GENEVA; PIERRE-MARIE ALLARD, UNIVERSITY OF GENEVA; ANDREAS SICHERT, INSTITUTE OF MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY; SAMMY PONTRELLI, INSTITUTE OF MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY; BENJAMIN S. PULLMAN, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; NUNO BANDEIRA, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; WILLIAM H. GERWICK, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; KATIA GINDRO, PLANT PROTECTION, MYCOLOGY GROUP; JOSEP MASSANA-CODINA, PLANT PROTECTION, MYCOLOGY GROUP; BERENIKE C. WAGNER, UNIVERSITY OF TUEBINGEN; KARL FORCHHAMMER, UNIVERSITY OF TUEBINGEN; DANIEL PETRAS, UNIVERSITY OF TUEBINGEN; NICOLE AIOSA, GEORGIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY; NEHA GARG, GEORGIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY; MANUEL LIEBEKE, MAX PLANCK INSTITUTE FOR MARINE MICROBIOLOGY; PATRIC BOURCEAU, MAX PLANCK INSTITUTE FOR MARINE MICROBIOLOGY; KYO BIN KANG, SOOKMYUNG WOMEN’S UNIVERSITY; HENNA GADHAVI, THE FRANCIS CRICK INSTITUTE; LUIZ PEDRO SORIO DE CARVALHO, THE FRANCIS CRICK INSTITUTE; MARIANA SILVA DOS SANTOS, THE FRANCIS CRICK INSTITUTE; ALICIA ISABEL PÉREZ-LORENTE, UNIVERSIDAD DE MÁLAGA-CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTÍFICAS; CARLOS MOLINA-SANTIAGO, UNIVERSIDAD DE MÁLAGA-CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTÍFICAS; DIEGO ROMERO, UNIVERSIDAD DE MÁLAGA-CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTÍFICAS; RAIMO FRANKE, HELMHOLTZ CENTRE FOR INFECTION RESEARCH; MARK BRÖNSTRUP, HELMHOLTZ CENTRE FOR INFECTION RESEARCH; ARTURO VERA PONCE DE LEÓN, NORWEGIAN UNIVERSITY OF LIFE SCIENCES; PHILLIP BYRON POPE, NORWEGIAN UNIVERSITY OF LIFE SCIENCES; SABINA LEANTI LA ROSA, NORWEGIAN UNIVERSITY OF LIFE SCIENCES; GIORGIA LA BARBERA, UNIVERSITY OF COPENHAGEN; HENRIK M. ROAGER, UNIVERSITY OF COPENHAGEN; MARTIN FREDERIK LAURSEN, UNIVERSITY OF DENMARK; FABIAN HAMMERLE, UNIVERSITY OF INNSBRUCK; BIANKA SIEWERT, UNIVERSITY OF INNSBRUCK; URSULA PEINTNER, UNIVERSITY OF INNSBRUCK; CUAUHTEMOC LICONA-CASSANI, CENTRO DE BIOTECNOLOGÍA FEMSA, TECNOLOGICO DE MONTERREY; LORENA RODRIGUEZ-ORDUÑA, CENTRO DE BIOTECNOLOGÍA FEMSA, TECNOLOGICO DE MONTERREY; EVELYN RAMPLER, UNIVERSITY OF VIENNA; FELINA HILDEBRAND, UNIVERSITY OF VIENNA; GUNDA KOELLENSPERGER, UNIVERSITY OF VIENNA; HARALD SCHOENY, UNIVERSITY OF VIENNA; KATHARINA HOHENWALLNER, UNIVERSITY OF VIENNA; LISA PANZENBOECK, UNIVERSITY OF VIENNA; RACHEL GREGOR, MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY; ELLIS CHARLES O'NEILL, UNIVERSITY OF NOTTINGHAM; EVE TALLULAH ROXBOROUGH, UNIVERSITY OF NOTTINGHAM; JANE ODOI, UNIVERSITY OF NOTTINGHAM; NICOLE J. BALE, NETHERLANDS INSTITUTE FOR SEA RESEARCH; SU DING, NETHERLANDS INSTITUTE FOR SEA RESEARCH; JAAP S. SINNINGHE DAMSTÉ, NETHERLANDS INSTITUTE FOR SEA RESEARCH; XUE LI GUAN, NANYANG TECHNOLOGICAL UNIVERSITY; JERRY J. CUI, THE OHIO STATE UNIVERSITY; KOU-SAN JU, THE OHIO STATE UNIVERSITY; DENISE BRENTAN SILVA, UNIVERSIDADE DO MATO GROSSO DO SUL; FERNANDA MOTTA RIBEIRO SILVA, UNIVERSIDADE DO MATO GROSSO DO SUL; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; HECTOR H. F. KOOLEN, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; CARLISMARI GRUNDMANN, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; JASON A. CLEMENT, BARUCH S. BLUMBERG INSTITUTE; HOSEIN MOHIMANI, CARNEGIE MELLON UNIVERSITY; KIRK BRODERS, OREGON STATE UNIVERSITY; KERRY L. MCPHAIL, OREGON STATE UNIVERSITY; SIDNEE E. OBER-SINGLETON, UNIVERSITY OF OREGON; CHRISTOPHER M. RATH, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; DANIEL MCDONALD, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; ROB KNIGHT, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO; MINGXUN WANG, UNIVERSITY OF CALIFORNIA RIVERSIDE; PIETER C. DORRESTEIN, UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO.
Título:  MicrobeMASST: a taxonomically informed mass spectrometry search tool for microbial metabolomics data.
Ano de publicação:  2024
Fonte/Imprenta:  Nature Microbiology, v. 9, p. 336-345, Feb. 2024.
DOI:  https://doi.org/10.1038/s41564-023-01575-9
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  microbeMASST, a taxonomically informed mass spectrometry (MS) search tool, tackles limited microbial metabolite annotation in untargeted metabolomics experiments. Leveraging a curated database of >60,000 microbial monocultures, users can search known and unknown MS/MS spectra and link them to their respective microbial producers via MS/MS fragmentation patterns. Identifcation of microbe-derived metabolites and relative producers without a priori knowledge will vastly enhance the understanding of microorganisms' role in ecology and human health.
Palavras-Chave:  Banco de dados; Ferramenta de pesquisa; Microbial.
Thesagro:  Espectrometria.
Thesaurus Nal:  Microorganisms.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA)
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CPAA39173 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, R. A. F. da; ALMEIDA, C. P. de; REIS, A.; AGUIAR, F. M.; CHAVERRI, P.; PINHO, D. B. Three new species of Gliocephalotrichum causing fruit rot on different hosts from Brazil. Mycologia, v. 112, n. 5, p. 1003-1016, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.
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2.Imagem marcado/desmarcadoZUFFA, S.; SCHMID, R.; BAUERMEISTER, A.; GOMES, P. W. P.; CARABALLO-RODRIGUEZ, A. M.; EL ABIEAD, Y.; ARON, A. T.; GENTRY, E. C.; ZEMLIN, J.; MEEHAN, M. J.; AVALON, N. E.; CICHEWICZ, R. H.; BUZUN, E.; CARRILLO TERRAZAS, M.; HSU, C. Y.; OLES, R.; AYALA, A. V.; ZHAO, J.; CHU, H.; KUIJPERS, M. C. M.; JACKREL, S. L.; TUGIZIMANA, F.; NEPHALI, L. P.; DUBERY, I. A.; MADALA, N. E.; MOREIRA, E. A.; COSTA-LOTUFO, L. V.; LOPES, N. P.; REZENDE-TEIXEIRA, P.; JIMENEZ, P. C.; RIMAL, B.; PATTERSON, A. D.; TRAXLER, M. F.; PESSOTTI, R. de C.; ALVARADO-VILLALOBOS, D.; TAMAYO-CASTILLO, G.; CHAVERRI, P.; ESCUDERO-LEYVA, E.; QUIROS-GUERRERO, L. M.; BORY, A. J.; JOUBERT, J.; RUTZ, A.; WOLFENDER, J. L.; ALLARD, P. M.; SICHERT, A.; PONTRELLI, S.; PULLMAN, B. S.; BANDEIRA, N.; GERWICK, W. H.; GINDRO, K.; MASSANA-CODINA, J.; WAGNER, B. C.; FORCHHAMMER, K.; PETRAS, D.; AIOSA, N.; GARG, N.; LIEBEKE, M.; BOURCEAU, P.; KANG, K. B.; GADHAVI, H.; CARVALHO, L. P. S. de; SANTOS, M. S. dos; PÉREZ-LORENTE, A. I.; MOLINA-SANTIAGO, C.; ROMERO, D.; FRANKE, R.; BRÖNSTRUP, M.; PONCE DE LEÓN, A. V.; POPE, P. B.; LA ROSA, S. L.; LA BARBERA, G.; ROAGER, H. M.; LAURSEN, M. F.; HAMMERLE, F.; SIEWERT, B.; PEINTNER, U.; LICONA-CASSANI, C.; RODRIGUEZ-ORDUÑA, L.; RAMPLER, E.; HILDEBRAND, F.; KOELLENSPERGER, G.; SCHOENY, H.; HOHENWALLNER, K.; PANZENBOECK, L.; GREGOR, R.; O'NEILL, E. C.; ROXBOROUGH, E. T.; ODOI, J.; BALE, N. J.; DING, S.; DAMSTÉ, J. S. S.; GUAN, X. L.; CUI, J. J.; JU, K. S.; SILVA, D. B.; SILVA, F. M. R.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F.; GRUNDMANN, C.; CLEMENT, J. A.; MOHIMANI, H.; BRODERS, K.; McPHAIL, K. L.; OBER-SINGLETON, S. E.; RATH, C. M.; McDONALD, D.; KNIGHT, R.; WANG, M.; DORRESTEIN, P. C. MicrobeMASST: a taxonomically informed mass spectrometry search tool for microbial metabolomics data. Nature Microbiology, v. 9, p. 336-345, Feb. 2024.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
3.Imagem marcado/desmarcadoHYDE, K. D.; ABDEL-WAHAB, M. A.; ABDOLLAHZADEH, J.; ABEYWICKRAMA, P. D.; ABSALAN, S.; AFSHARI, N.; AINSWORTH, A. M.; AKULOV, O. Y.; ALEOSHIN, V. V.; AL-SADI, A. M.; ALVARADO, P.; ALVES, A.; ALVES-SILVA, G.; AMALFI, M.; AMIRA, Y.; AMUHENAGE, T. B.; ANDERSON, J. L.; ANTONÍN, V.; AOUALI, S.; APTROOT, A.; APURILLO, C. C. S.; ARAÚJO, J. P. M.; ARIYAWANSA, H. A.; ARMAND, A.; ARUMUGAM, E.; ASGHARI, R.; ASSIS, D. M. A.; ATIENZA, V.; AVASTHI, S.; AZEVEDO, E.; BAHKALI, A. H.; BAKHSHI, M.; BANIHASHEMI, Z.; BAO, D. F.; BARAL, H. O.; BARATA, M.; BARBOSA, F. R.; BARBOSA, R. N.; BARRETO, R. W.; BASCHIEN, C.; BELAMESIATSEVA, D. B.; BENNETT REUEL, M.; BERA, I.; BEZERRA, J. D. P.; BEZERRA, J. L.; BHAT, D. J.; BHUNJUN, C. S.; BIANCHINOTTI, M. V.; BŁASZKOWSKI, J.; BLONDELLE, A.; BOEKHOUT, T.; BONITO, G.; BOONMEE, S.; BOONYUEN, N.; BREGANT, C.; BUCHANAN, P.; BUNDHUN, D.; BURGAUD, G.; BURGESS, T.; BUYCK, B.; CABARROI-HERNÁNDEZ, M.; CÁCERES, M. E. S.; CAEIRO, M. F.; CAI, L.; CAI, M. F.; CALABON, M. S.; CALAÇA, F. J. S.; CALLALLI, M.; CAMARA, M. P. S.; CANO-LIRA, J. F.; CANTILLO, T.; CAO, B.; CARLAVILLA, J. R.; CARVALHO, A.; CASTAÑEDA-RUIZ, R. F.; CASTLEBURY, L.; CASTRO-JAUREGUI, O.; CATANIA, M. D. V.; CAVALCANTI, L. H.; CAZABONNE, J.; CEDEÑO-SANCHEZ, M. L.; CHAHARMIRI-DOKHAHARANI, S.; CHAIWAN, N.; CHAKRABORTY, N.; CHAVERRI, P.; CHEEWANGKOON, R.; CHEN, C.; CHEN, C. Y.; CHEN, K. H.; CHEN, J.; CHEN, Q.; CHEN, W. H.; CHEN, Y. P.; CHETHANA, K. W. T.; COLEINE, C.; CONDÉ, T. O.; CORAZON-GUIVIN, M. A.; CORTÉS-PÉREZ, A.; COSTA-REZENDE, D. H.; COURTECUISSE, R.; CROUCH, J. A.; CROUS, P. W.; CUI, B. K.; CUI, Y. Y.; SILVA, D. K. A. da; SILVA, G. A. da; SILVA, I. R. da; SILVA, R. M. F. da; SILVA SANTOS, A. C. da; DAI, D. Q.; DAY, Y. C.; DAMM, U.; DARMOSTUK, V.; DAROODI ZOHA; DAS, K.; DAS, K.; DAVOODIAN, N.; DAVYDOV, E. A.; DAYARATHNE, M. C.; DECOCK, C.; DE GROOT, M. D.; DE KESEL, A.; DELA CRUZ, T. E. E.; DE LANGE, R.; DELGADO, G.; DENCHEV, C. M.; DENCHEV, T. T.; OLIVEIRA, N. T. de; SILVA, N. T. de; SOUZA, F. A. de; DENTINGER, B.; DEVADATHA, B.; DIANESE, J. C.; DIMA, B.; DINIZ, A. G.; DISSANAYAKE, A. J.; DISSANAYAKE, L. S.; DOĞAN, H. H.; DOILOM, M.; DOLATABADI, S.; DONG, W.; DONG, Z. Y.; SANTOS, L. A. dos; DRECHSLER-SANTOS, E. R.; DU, T. Y.; DUBEY, M. K.; DUTTA, A. K.; EGIDI, E.; ELLIOTT, T. F.; ELSHAHED, M. S.; ERDOĞDU, M.; ERTZ, D.; ETAYO, J.; EVANS, H. C.; FAN, X. L.; FAN, Y. G.; FEDOSOVA, A. G.; FELL, J.; FERNANDES, I.; FIRMINO, A. L.; FIUZA, P. O.; FLAKUS, A.; SOUZA, C. A. F. de; FRISVAD, J. C.; FRYAR, A. C.; GABALDÓN, T.; GAJANAYAKE, A. J.; GALINDO, L. J.; GANNIBAL, P. B.; GARCIA, D.; GARCÍA-SANDOVAL, S. R.; GARRIDO-BENAVENT, I.; GARZOLI, L.; GAUTAM, A. K.; GE, Z. W.; GENÉ, D. J.; GENTEKAKI, E.; GHOBAD-NEJHAD, M.; GIACHINI, A. J.; GIBERTONI, T. B.; GÓES-NETO, A.; GOMDOLA, D.; FARIAS, A. R. G. de. Global consortium for the classification of fungi and fungus-like taxa. Mycosphere, v. 14, n. 1, p. 1960–2012, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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